Деревня Нолишки - существующий населенный пункт - http://rodnaya-vyatka.ru/places/96268.
Ну да, он находится в Уржумском районе, т.е. там же.
Малые Ноли на речке Ноля немного западнее
Да, действительно, между Малыми Нолями и Нолишками (т.е. "сверхмалыми" Нолями) - около 13 км.
По расположению это похоже на бывшую марийскую деревню Малые Ноли. Отсюда и уменьшительный суффикс, вероятно. Ну, а с корнем уже разбирались.